L'origine del microscopio fu data dal fatto che gli antichi sapevano che guardare attraverso specchi curvi o sfere di vetro con l'acqua, faceva vedere le piccole cose con l'ingrandimento. È allora che i primi decenni del XVII secolo iniziarono ad effettuare prove con lenti al fine di ottenere un maggior ingrandimento degli oggetti. Per questo si basarono sul primo strumento realizzato con lenti che ebbe grande successo "il telescopio " utilizzato per la prima volta a scopo astronomico da Galileo nell'anno 1609.
All'inizio del XX secolo la produzione di questo era concentrata principalmente in Germania e negli anni successivi furono sviluppati contrasto di fase, fluorescenza, olografia, interferenza, raggi X, luce ultravioletta, metodi con elettroni e protoni. Sono stati sviluppati anche microscopi computerizzati per la quantificazione, quantificazione e analisi tridimensionale, questi strumenti hanno aperto molti campi nel campo della microscopia. Dal 1660 ad oggi il microscopio ottico è stato il pilastro fondamentale per lo studio dell'invisibile. Tuttavia, la sua risoluzione è aumentata nel tempo con il miglioramento della qualità delle lenti e del suo potere di ingrandimento.
Nel 1930 il mondo submicroscopico è stato ampliato con la creazione del microscopio elettronico la cui principale differenza rispetto al microscopio ottico è l'aumento di 1000 volte maggiore nella fase di ingrandimento del materiale osservato, accompagnato da una migliore capacità di risoluzione generando una migliore definizione e ingrandimento nel mondo microscopico.
Esistono due tipi di microscopi elettronici di base , entrambi sono stati inventati contemporaneamente ma svolgono funzioni diverse, queste sono:
- Microscopio elettronico a trasmissione (MET): è responsabile della proiezione di elettroni attraverso un sottile strato di materiale o tessuto da osservare, riflettendo un'immagine su uno schermo fosforescente.
- Microscopio elettronico a scansione (SEM): produce un'immagine che dà l'impressione di essere in tre dimensioni. Questo microscopio utilizza tre o due punti in cui arrivano gli elettroni del campione per scansionare la superficie del campione da osservare.
La maggior parte dei pionieri della microscopia elettronica in biologia sono ancora vivi e i più importanti sono: Albert Claude, Earnest Fullam, Don Fawcett, Charles Leblond, John Luft, Daniel Pease, Keith Porter e George Palade.