È l'organo sessuale maschile o copulatorio, ha un corpo cilindrico e l'estremità del disco ed è costituito dal glande, il cui vertice è il meato uretrale, il prepuzio cioè la parte del pene che copre il glande quando non è in posizione erezione. Mostra una lunghezza di circa 12 centimetri allo stato flaccido e di circa 16 centimetri allo stato di erezione.
Nella sua parte interna si distinguono i corpi cavernosi e il corpo spugnoso dell'uretra, che sono entrambe formazioni erettili, la cui disposizione e struttura permettono al pene di raggiungere il suo stato allungato ed eretto durante il rapporto. Raggiungendolo riempiendolo di sangue, per il quale manca il baculum o le ossa.
La struttura del pene umano è costituita da tre colonne di tessuto erettile: due corpi cavernosi che si trovano uno accanto all'altro sulla sommità del pene e il corpo spugnoso che si trova sul fondo. Il glande è l'area più sensibile, essendo questa l'estremità del corpo spugnoso ed è la parte più ampia di esso.Ha una forma conica ed è ricoperta da una piega cutanea sciolta chiamata prepuzio che viene tirata indietro per esporre il glande.
L' area inferiore del pene in cui è attaccato il prepuzio è chiamata frenulo. L'uretra è il passaggio dell'urina e del flusso seminale, che passa attraverso il corpo spugnoso e termina in un orifizio chiamato meato urinario, essendo all'estremità del glande. Lo sperma è liquido seminale e che viene prodotto nei testicoli e immagazzinato nell'epididimo, durante l' eiaculazione lo sperma viene spinto ai dotti deferenti, che sono due tubi muscolari circondati da muscoli lisci di circa 45 centimetri ciascuno di lunghezza. Collegato all'epididimo che il contratto espelle lo sperma ai dotti eiaculatori.
Essendo i liquidi aggiunti dalle vescicole seminali e unendo l'uretra all'interno della prostata insieme alle ghiandole bulbouretrali aderiscono alle secrezioni e c'è il passaggio finale affinché lo sperma esca dallo sperma attraverso il pene producendo eiaculazione quando raggiunge l' orgasmo maschile.